Германия XVII-го столетия. 30-летняя война и чума сделали 13-летнего мальчика по имени Крабат сиротой. В поисках крова и еды, он таинственным образом попадает на мельницу, где становится учеником ее хозяина. 

Вскоре Крабат узнает, что мельница — школа черной магии и плата за уроки Мастера высока…